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UMDPCS : UNITÉ MIXTE DE DÉVELOPPEMENT PROFESSIONNEL CONTINU SANTÉ (FORMATION CONTINUE)

DU Séquençage haut débit et maladies génétiques (SHD)

DU
Séquençage haut débit
et maladies génétiques

 

Responsables

M. Yannis DUFFOURD, Ingénieur de recherche en bio-informatique CHU Dijon, INSERM U1231

Pr Christel THAUVIN-ROBINET, Professeur des Universités - Praticien Hospitalier, Centre de Génétique, Hôpital d'Enfants CHU Dijon Bourgogne  

 

Présentation

Le séquençage à haut débit (SHD) ou séquençage nouvelle génération représente une révolution en génétique. Il permet le déchiffrage automatisé de nucléotides provenant du génome humain.

La formation « Séquençage haut débit et maladies génétiques » apporte les connaissances et compétences nécessaires pour utiliser cette méthodologie et ses applications dans le contexte du diagnostic des maladies génétiques. Elle fait un focus particulier sur la qualité des données produites dans un contexte de laboratoire médical ainsi que les considérations éthiques que soulève le séquençage haut débit pour l'interprétation et le rendu des résultats.

 

Objectifs de la formation

  • Identifier les outils bio-informatiques utilisés pour le traitement des données brutes, l'identification de variations génétiques et l'interprétation des résultats.
  • Utiliser le système Unix/Linux, la ligne de commande, la gestion et l'analyse de données sur un serveur à distance.
  • Utiliser les principaux logiciels dédiés à l'analyse de données de séquençage haut débit, de l'alignement des séquences brutes à l'annotation de variations génétiques
  • Maîtriser les principaux navigateurs, bases de données et outils de prédiction couramment utilisés en génétique humaine et médicale

 

Organisation pédagogique

105 heures d’enseignement sur 1 année universitaire.

Pratique pédagogique

  • 5 modules de 21 heures (3 jours) en présentiel.

Les enseignements ont lieu à l’UFR des Sciences de Santé, Dijon

Pour plus d’information, se référer au calendrier de la formation.

 

Contenu

5 modules

  • Séquençage nouvelle génération - Technologies et applications (théorique)
  • Introduction à Linux et à la programmation (pratique)
  • Analyse de données de séquençage haut débit (pratique)
  • Bases de données, outils de prédiction in silico et analyses approfondies (pratique et théorique)
  • Séquençage haut débit et diagnostic - Exemples d'applications, qualité, rendu des résultats et considérations éthiques (théorique)

 

Public

  • Généticiens
  • Médecins biologistes en génétique moléculaire
  • Ingénieurs en génétique humaine/médicale
  • Étudiants et stagiaires post-doctoraux de ces disciplines

 

Validation de la formation

Epreuve écrite.

La participation à l’ensemble des enseignements est obligatoire.

 

Intervenants

M. Y. DUFFOURD, Ingénieur de recherche en bio-informatique CHU Dijon, INSERM U1231
Pr C. THAUVIN-ROBINET, Professeur des Universités - Praticien Hospitalier, Centre de Génétique, Hôpital d'Enfants CHU Dijon Bourgogne 

 

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Documents à télécharger

Cliquez sur le lien pour accéder au calendrier de la formation :

 

• DU Séquençage Haut Débit et maladies génétiques - 23/24

Tarif

  • Droits administratifs :
    selon tarifs définis annuellement par le CA de l'UB / le Ministère
  • Droits pédagogiques : 1100€

Contacter Josephine MENTH

Pour toute demande concernant cette formation, vous pouvez contacter Josephine MENTH via l'adresse :

Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

 

 

Par téléphone : 03 80 39 34 96

L’accueil téléphonique est disponible du lundi au vendredi de 10h à 12h et de 13h30 à 16h

 

Adresse postale:
UMDPCS
Unité Mixte de Développement Continu Santé
Bâtiment B2 Médecine
2 Bd du Maréchal de Lattre de Tassigny
CS 36621
21066 DIJON CEDEX

Université de Bourgogne