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UMDPCS : UNITÉ MIXTE DE DÉVELOPPEMENT CONTINU SANTÉ (FORMATION CONTINUE)

DU Séquençage haut débit et maladies génétiques

Sequencage haut debit

 

Responsable

Pr Frédéric HUET, Professeur des Universités - Praticien Hospitalier UFR des Sciences de Santé, Chef de service, Pédiatrie CHU Dijon

 

Présentation

Le séquençage à haut débit (SHD) ou séquençage nouvelle génération représente une révolution en génétique. Il permet le déchiffrage automatisé de nucléotides provenant du génome humain.

La formation « Séquençage haut débit et maladies génétiques » apporte les connaissances et compétences nécessaires pour utiliser cette méthodologie et ses applications dans le contexte du diagnostic des maladies génétiques. Elle fait un focus particulier sur la qualité des données produites dans un contexte de laboratoire médical ainsi que les considérations éthiques que soulève le séquençage haut débit pour l'interprétation et le rendu des résultats.

 

Objectifs de la formation

  • Identifier les outils bio-informatiques utilisés pour le traitement des données brutes, l'identification de variations génétiques et l'interprétation des résultats.
  • Utiliser le système Unix/Linux, la ligne de commande, la gestion et l'analyse de données sur un serveur à distance.
  • Utiliser les principaux logiciels dédiés à l'analyse de données de séquençage haut débit, de l'alignement des séquences brutes à l'annotation de variations génétiques
  • Maîtriser les principaux navigateurs, bases de données et outils de prédiction couramment utilisés en génétique humaine et médicale

 

Organisation pédagogique

105 heures d’enseignement sur une année universitaire.

Pratique pédagogique :

  • 5 modules de 21 heures (3 jours) en présentiel.

Les enseignements ont lieu à l’UFR des Sciences de Santé, Dijon

Pour plus d’information, se référer au calendrier de la formation

 

Contenu

5 modules

  • Séquençage nouvelle génération - Technologies et applications (théorique)
  • Introduction à Linux et à la programmation (pratique)
  • Analyse de données de séquençage haut débit (pratique)
  • Bases de données, outils de prédiction in silico et analyses approfondies (pratique et théorique)
  • Séquençage haut débit et diagnostic - Exemples d'applications, qualité, rendu des résultats et considérations éthiques (théorique)

 

Public

  • Généticiens
  • Médecins biologistes en génétique moléculaire
  • Ingénieurs en génétique humaine/médicale
  • Étudiants et stagiaires post-doctoraux de ces disciplines

 

Validation de la formation

Epreuve écrite.

La participation à l’ensemble des enseignements est obligatoire.

 

Intervenants

Pr. F. HUET, Professeur des Universités - Praticien Hospitalier UFR des Sciences de Santé, Chef de service, Pédiatrie CHU Dijon

Mr Y. DUFFOURD, Ingénieur de recherche en bio-informatique CHU Dijon

 

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Calendrier

Cliquez sur le lien pour accéder au calendrier de la formation :

• Séquençage Haut Débit - 2018 - 2019

 

Tarifs

  • Droits administratifs :
    selon tarifs définis annuellement par le CA de l'UB / le Ministère
  • Droits pédagogiques : 1100€

Nous contacter

Par mail :
Pour toutes questions au sujet de nos formations, contactez l'UMDPCS

 

Par téléphone :
03.80.39.34.96
de 10h00 à 11h30 et de 14h00 à 16h30

 

Par courrier:
UMDPCS
UFR des Sciences de Santé
7 boulevard Jeanne d'Arc
21000 DIJON

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